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      行業資訊

      酶解or超聲?看小美非接觸超聲波DNA打斷儀如何大顯身手

      來源:上海凈信  發布時間:2022-11-03 點擊量:419

        在NGS檢測實驗中,DNA文庫構建的第一步就是將DNA隨機打斷成符合各測序平臺讀長的片段。相信熟悉NGS文庫構建的科研人員一定糾結過這個問題,是用酶解打斷還是超聲波打斷?

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        目前DNA打斷的最主要的方法超聲法和酶解法。但是這兩種方法在實際使用中各具優勢,需要根據實驗者自身的情況進行選擇。

        超聲波打斷法:

        操作簡單,耗時短,成本低;隨機片段化,無GC序列偏好;剪切效果不受DNA濃度影響

        片段化結果集中度高,目的長度片段得率高。

        酶切法:

        實驗要求嚴格,針對不同樣本合適的片段化條件摸索不易,成本較高;存在序列偏好性;需要根據樣本濃度改變酶濃度,酶活性易受到溶液成分影響;目標長度片段集中度較低。

        超聲打斷法的優勢顯而易見,而常用的超聲波打斷儀分為接觸式和非接觸式。相比傳統的探頭超聲波破碎儀,探頭與樣品直接接觸,一次只能處理一個樣品,實驗周期長。小美非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產品可在密閉容器下進行破碎,不產生感染性飛霧,超聲探頭與樣品不接觸,避免交叉污染。對于每天要處理多個樣品或者貴重樣品的實驗室,此款儀器具有處理高通量,樣本低損耗,無交叉污染等優勢。逐漸成為ChIP(染色質免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺不可缺少的標準化工具。

        小美超聲非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產品具有通量高、實驗一致性好,實驗重復性好、片段得率高等優點。專為二代測序DNA樣本與染色質免疫共沉淀實驗樣本前處理量身訂做的,應用領域包含:細菌細胞破碎、蛋白質抽提;二代測序樣本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均質、加速溶解、催化反應等。

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        采用等溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合;用于無菌、可超微量破碎,隔著離心管能打斷染色體。深受各大基因公司、生物公司、測序公司的青睞!

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