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酶解or超聲?看小美非接觸超聲波DNA打斷儀如何大顯身手

來(lái)源:上海凈信  發(fā)布時(shí)間:2022-11-03 點(diǎn)擊量:485

  在NGS檢測實(shí)驗中,DNA文庫構建的第一步就是將DNA隨機打斷成符合各測序平臺讀長(cháng)的片段。相信熟悉NGS文庫構建的科研人員一定糾結過(guò)這個(gè)問(wèn)題,是用酶解打斷還是超聲波打斷?

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  目前DNA打斷的最主要的方法超聲法和酶解法。但是這兩種方法在實(shí)際使用中各具優(yōu)勢,需要根據實(shí)驗者自身的情況進(jìn)行選擇。

  超聲波打斷法:

  操作簡(jiǎn)單,耗時(shí)短,成本低;隨機片段化,無(wú)GC序列偏好;剪切效果不受DNA濃度影響

  片段化結果集中度高,目的長(cháng)度片段得率高。

  酶切法:

  實(shí)驗要求嚴格,針對不同樣本合適的片段化條件摸索不易,成本較高;存在序列偏好性;需要根據樣本濃度改變酶濃度,酶活性易受到溶液成分影響;目標長(cháng)度片段集中度較低。

  超聲打斷法的優(yōu)勢顯而易見(jiàn),而常用的超聲波打斷儀分為接觸式和非接觸式。相比傳統的探頭超聲波破碎儀,探頭與樣品直接接觸,一次只能處理一個(gè)樣品,實(shí)驗周期長(cháng)。小美非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產(chǎn)品可在密閉容器下進(jìn)行破碎,不產(chǎn)生感染性飛霧,超聲探頭與樣品不接觸,避免交叉污染。對于每天要處理多個(gè)樣品或者貴重樣品的實(shí)驗室,此款儀器具有處理高通量,樣本低損耗,無(wú)交叉污染等優(yōu)勢。逐漸成為ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺不可缺少的標準化工具。

  小美超聲非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產(chǎn)品具有通量高、實(shí)驗一致性好,實(shí)驗重復性好、片段得率高等優(yōu)點(diǎn)。專(zhuān)為二代測序DNA樣本與染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗樣本前處理量身訂做的,應用領(lǐng)域包含:細菌細胞破碎、蛋白質(zhì)抽提;二代測序樣本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均質(zhì)、加速溶解、催化反應等。

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  采用等溫、非接觸的方式對樣品進(jìn)行打斷、勻漿和混合;用于無(wú)菌、可超微量破碎,隔著(zhù)離心管能打斷染色體。深受各大基因公司、生物公司、測序公司的青睞!

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